2020年5月,我中心2017级硕士研究生苟元元同学以第一作者身份在Elsevier旗下期刊Scientia Horticulturae发表题为《Comparative transcriptome analysis reveals the potential molecular mechanism involved in fatty acids biosynthesis of Juglans regia》()的论文(图1),通讯作者为该生导师许锋教授和陈泽雄教授。
图1 论文封面
核桃是一种营养丰富的落叶果树,富含大量脂肪酸,核桃根茎叶中脂肪酸的研究相对较少,对于脂肪酸在核桃不同组织中的积累模式尚且不清晰。本研究对核桃根、茎、叶三个组织进行转录组测序分析,从分子水平揭示核桃脂肪酸的合成及调控机理,并对各个组织中不同种类脂肪酸含量进行测定,GC-MS分析显示茎中脂肪酸总含量最高。利用转录组测序技术在核桃不同组织中发掘了122个参与脂肪酸合成代谢的差异基因,进一步筛选得到16个基因的表达水平与核桃不同组织的脂肪酸含量显著相关(图2),其中11个基因的表达水平与脂肪酸含量显著正相关,5个基因的表达与脂肪酸含量显著负相关。相关结果表明,这些关键基因在核桃脂肪酸的合成代谢过程中起着重要的调控作用。本研究为脂肪酸代谢途径的分子调控提供了丰富的测序信息,为进一步研究核桃脂肪酸生物合成提供了分子基础。
图2 关键基因脂肪酸合成代谢通路中的表达模式